项目因建设单位原因导致工期长期延误，应如何处理？

不知你是代表哪一方。监理？业主?承包商？各自利益不同，处理要求自然不同。
根据FIDIC的原则（我国的施工合同范本也是参照FIDIC来的），如果因业主原因导致工期延长，承包商可以索赔。索赔的内容包括：EOT（延长工期），延期部分的直接费用增加，增加的管理费（包括总部管理费），延期阶段的应得利润，延期部分的物价上涨，延期部分的保险费，保函手续费，融资成本等。
如果延期阶段项目已暂停施工超过90天，承包商可以要求终止合同，进行项目清算。清算内容如下：已完工作的应得款项，未完工作估价并要求业主支付，为本项目采购的专用设备材料的剩余价值赔偿，本项目未摊销完的临时设施及间接费（比如进出场费，临时建筑费用等），损失的应得利润。
国内的具体规定参见合同法和建设工程管理的相关规定，建设工程合同范本，本项目签订的合同内容。主要看合同是怎么约定的，在不违反法律明文规定的情况下，合同约定优先。比如合同规定此等情况不能索赔，虽然明显不合理，但也是有效，损失就由承包商承担了。